В школе организована внеурочная спортивная деятельность по таким направлениям, как волейбол, мини-футбол, спортивные танцы, эстетическая гимнастика. Эффективно ведется работа с детьми с особыми образовательными потребностями: одаренными, детьми с ОВЗ.
При МБОУ «КСОШ №2» открыт интернат для проживания детей из отдалённых населённых пунктов Кежемского района.
Учреждение является базовой площадкой для организации летнего оздоровительного отдыха.
Для обеспечения безопасности в школе установлена система контроля доступа, система видеонаблюдения, аварийная пожарная сигнализация, система аварийного освещения.